Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PCDHA12Q9UN75 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCDHA12Q9UN75 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCDHA12Q9UN75 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCDHA12Q9UN75 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCDHA12Q9UN75 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCDHA12Q9UN75 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCDHA12Q9UN75 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCDHA12Q9UN75 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCDHA12Q9UN75 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCDHA12Q9UN75 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCDHA12Q9UN75 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCDHA12Q9UN75 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCDHA12Q9UN75 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCDHA12Q9UN75 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCDHA12Q9UN75 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCDHA12Q9UN75 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCDHA12Q9UN75 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCDHA12Q9UN75 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCDHA12Q9UN75 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCDHA12Q9UN75 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCDHA12Q9UN75 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCDHA12Q9UN75 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PCDHA12Q9UN75 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCDHA12Q9UN75 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCDHA12Q9UN75 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCDHA12Q9UN75 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCDHA12Q9UN75 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCDHA12Q9UN75 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCDHA12Q9UN75 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCDHA12Q9UN75 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCDHA12Q9UN75 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCDHA12Q9UN75 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCDHA12Q9UN75 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCDHA12Q9UN75 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCDHA12Q9UN75 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCDHA12Q9UN75 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCDHA12Q9UN75 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCDHA12Q9UN75 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCDHA12Q9UN75 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCDHA12Q9UN75 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCDHA12Q9UN75 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCDHA12Q9UN75 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCDHA12Q9UN75 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCDHA12Q9UN75 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCDHA12Q9UN75 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCDHA12Q9UN75 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCDHA12Q9UN75 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCDHA12Q9UN75 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCDHA12Q9UN75 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCDHA12Q9UN75 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCDHA12Q9UN75 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCDHA12Q9UN75 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCDHA12Q9UN75 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCDHA12Q9UN75 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCDHA12Q9UN75 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCDHA12Q9UN75 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCDHA12Q9UN75 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCDHA12Q9UN75 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCDHA12Q9UN75 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCDHA12Q9UN75 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCDHA12Q9UN75 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCDHA12Q9UN75 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCDHA12Q9UN75 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCDHA12Q9UN75 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCDHA12Q9UN75 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCDHA12Q9UN75 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCDHA12Q9UN75 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCDHA12Q9UN75 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCDHA12Q9UN75 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCDHA12Q9UN75 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCDHA12Q9UN75 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCDHA12Q9UN75 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCDHA12Q9UN75 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCDHA12Q9UN75 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCDHA12Q9UN75 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCDHA12Q9UN75 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCDHA12Q9UN75 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCDHA12Q9UN75 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCDHA12Q9UN75 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCDHA12Q9UN75 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCDHA12Q9UN75 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCDHA12Q9UN75 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCDHA12Q9UN75 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCDHA12Q9UN75 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCDHA12Q9UN75 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCDHA12Q9UN75 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCDHA12Q9UN75 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCDHA12Q9UN75 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCDHA12Q9UN75 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCDHA12Q9UN75 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCDHA12Q9UN75 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCDHA12Q9UN75 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCDHA12Q9UN75 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCDHA12Q9UN75 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCDHA12Q9UN75 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCDHA12Q9UN75 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PCDHA12Q9UN75 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCDHA12Q9UN75 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCDHA12Q9UN75 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms