Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TSSK4Q6SA08 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms