Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 ISYNA1-213ENST00000583534 629 ntTSL 1 (best)19.09■□□□□ 0.651e-7■■■■□ 26
PCBP2Q15366 ISYNA1-205ENST00000578352 592 ntTSL 217.32■□□□□ 0.361e-7■■■■□ 26
PCBP2Q15366 ISYNA1-208ENST00000581800 627 ntTSL 414.69□□□□□ -0.061e-7■■■■□ 26
PCBP2Q15366 ZKSCAN1-206ENST00000620510 9192 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.776e-10■■■■□ 26
PCBP2Q15366 IMMP2L-209ENST00000489381 856 ntTSL 55.69□□□□□ -1.51e-6■■■■□ 26
PCBP2Q15366 IMMP2L-205ENST00000450877 761 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.631e-6■■■■□ 26
PCBP2Q15366 MTA3-209ENST00000454356 1702 ntTSL 529.42■■■□□ 2.31e-6■■■■□ 26
PCBP2Q15366 MTA3-204ENST00000406911 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.811e-6■■■■□ 26
PCBP2Q15366 MTA3-206ENST00000409019 2525 ntTSL 59.51□□□□□ -0.891e-6■■■■□ 26
PCBP2Q15366 MTA3-201ENST00000405094 1785 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.241e-6■■■■□ 26
PCBP2Q15366 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.796e-7■■■■□ 26
PCBP2Q15366 SPATS2L-220ENST00000457757 835 ntTSL 516.66■□□□□ 0.266e-7■■■■□ 26
PCBP2Q15366 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.246e-7■■■■□ 26
PCBP2Q15366 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.186e-7■■■■□ 26
PCBP2Q15366 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.116e-7■■■■□ 26
PCBP2Q15366 SPATS2L-208ENST00000409718 2648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.456e-7■■■■□ 26
PCBP2Q15366 SPATS2L-205ENST00000409151 1979 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.466e-7■■■■□ 26
PCBP2Q15366 SPATS2L-206ENST00000409385 2320 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.796e-7■■■■□ 26
PCBP2Q15366 SPATS2L-219ENST00000453663 637 ntTSL 49.42□□□□□ -0.96e-7■■■■□ 26
PCBP2Q15366 SPATS2L-207ENST00000409397 920 ntTSL 38.54□□□□□ -1.046e-7■■■■□ 26
PCBP2Q15366 SPATS2L-201ENST00000358677 6156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.116e-7■■■■□ 26
PCBP2Q15366 SPATS2L-227ENST00000619961 6115 ntTSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.136e-7■■■■□ 26
PCBP2Q15366 INPPL1-208ENST00000540329 741 ntTSL 314.57□□□□□ -0.084e-16■■■■□ 25.9
PCBP2Q15366 THOC2-209ENST00000448128 1365 ntTSL 56.84□□□□□ -1.312e-6■■■■□ 25.9
PCBP2Q15366 THOC2-219ENST00000497887 768 ntTSL 36.76□□□□□ -1.332e-6■■■■□ 25.9
PCBP2Q15366 THOC2-217ENST00000492203 641 ntTSL 36.38□□□□□ -1.392e-6■■■■□ 25.9
PCBP2Q15366 THOC2-208ENST00000441692 4364 ntTSL 53.82□□□□□ -1.82e-6■■■■□ 25.9
PCBP2Q15366 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.053e-6■■■■□ 25.9
PCBP2Q15366 EIF4E-209ENST00000507665 1143 ntTSL 27.42□□□□□ -1.223e-6■■■■□ 25.9
PCBP2Q15366 EIF4E-205ENST00000504472 588 ntTSL 45.97□□□□□ -1.453e-6■■■■□ 25.9
PCBP2Q15366 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.463e-6■■■■□ 25.9
PCBP2Q15366 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.553e-6■■■■□ 25.9
PCBP2Q15366 EIF4E-204ENST00000504432 1132 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.553e-6■■■■□ 25.9
PCBP2Q15366 EIF4E-210ENST00000511644 686 ntTSL 54.71□□□□□ -1.663e-6■■■■□ 25.9
PCBP2Q15366 EIF4E-211ENST00000515638 738 ntTSL 53.7□□□□□ -1.823e-6■■■■□ 25.9
PCBP2Q15366 NLK-201ENST00000407008 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.113e-6■■■■□ 25.9
PCBP2Q15366 ACTN4-204ENST00000440400 3180 ntTSL 513□□□□□ -0.339e-7■■■■□ 25.9
PCBP2Q15366 CUL4B-205ENST00000467641 836 ntTSL 312.75□□□□□ -0.375e-12■■■■□ 25.9
PCBP2Q15366 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.61e-7■■■■□ 25.9
PCBP2Q15366 TM9SF2-201ENST00000376387 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.621e-30■■■■□ 25.9
PCBP2Q15366 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.582e-6■■■■□ 25.9
PCBP2Q15366 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.582e-6■■■■□ 25.9
PCBP2Q15366 LPAR2-204ENST00000588233 558 ntTSL 321.05■□□□□ 0.962e-6■■■■□ 25.9
PCBP2Q15366 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.752e-6■■■■□ 25.9
PCBP2Q15366 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.672e-6■■■■□ 25.9
PCBP2Q15366 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.442e-6■■■■□ 25.9
PCBP2Q15366 LPAR2-207ENST00000590629 595 ntTSL 316.65■□□□□ 0.262e-6■■■■□ 25.9
PCBP2Q15366 LPAR2-205ENST00000588461 609 ntTSL 415.95■□□□□ 0.142e-6■■■■□ 25.9
PCBP2Q15366 LPAR2-208ENST00000591042 585 ntTSL 413.27□□□□□ -0.292e-6■■■■□ 25.9
PCBP2Q15366 LPAR2-209ENST00000592061 480 ntTSL 38.82□□□□□ -12e-6■■■■□ 25.9
PCBP2Q15366 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.231e-6■■■■□ 25.9
PCBP2Q15366 SALL2-201ENST00000450879 3178 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.891e-6■■■■□ 25.9
PCBP2Q15366 SALL2-204ENST00000546363 3094 ntTSL 29.34□□□□□ -0.911e-6■■■■□ 25.9
PCBP2Q15366 RAB1A-205ENST00000494188 771 ntTSL 221.8■■□□□ 1.081e-13■■■■□ 25.9
PCBP2Q15366 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.861e-13■■■■□ 25.9
PCBP2Q15366 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.261e-13■■■■□ 25.9
PCBP2Q15366 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.131e-13■■■■□ 25.9
PCBP2Q15366 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.291e-13■■■■□ 25.9
PCBP2Q15366 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.211e-7■■■■□ 25.9
PCBP2Q15366 SLC1A5-204ENST00000593713 774 ntTSL 310.55□□□□□ -0.721e-9■■■■□ 25.8
PCBP2Q15366 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.912e-6■■■■□ 25.8
PCBP2Q15366 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.112e-6■■■■□ 25.8
PCBP2Q15366 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.461e-6■■■■□ 25.8
PCBP2Q15366 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.491e-6■■■■□ 25.8
PCBP2Q15366 AL390728.4-204ENST00000606454 660 ntTSL 314.38□□□□□ -0.112e-20■■■■□ 25.8
PCBP2Q15366 AL390728.4-203ENST00000606212 637 ntTSL 312.95□□□□□ -0.342e-20■■■■□ 25.8
PCBP2Q15366 AL390728.4-202ENST00000606173 430 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.612e-20■■■■□ 25.8
PCBP2Q15366 AL390728.4-201ENST00000421406 1465 ntBASIC8.26□□□□□ -1.092e-20■■■■□ 25.8
PCBP2Q15366 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.022e-8■■■■□ 25.8
PCBP2Q15366 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.212e-8■■■■□ 25.8
PCBP2Q15366 TTLL3-202ENST00000383827 4834 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.664e-17■■■■□ 25.8
PCBP2Q15366 TTLL3-225ENST00000473661 3811 ntTSL 510.22□□□□□ -0.774e-17■■■■□ 25.8
PCBP2Q15366 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.972e-6■■■■□ 25.8
PCBP2Q15366 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.152e-6■■■■□ 25.8
PCBP2Q15366 SNRK-201ENST00000296088 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.522e-6■■■■□ 25.8
PCBP2Q15366 SNRK-202ENST00000429705 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.532e-6■■■■□ 25.8
PCBP2Q15366 SNRK-208ENST00000484791 540 ntTSL 36.31□□□□□ -1.42e-6■■■■□ 25.8
PCBP2Q15366 ZNF3-206ENST00000415068 543 ntTSL 1 (best)13.12□□□□□ -0.313e-10■■■■□ 25.8
PCBP2Q15366 ZNF3-204ENST00000412947 595 ntTSL 1 (best)12.15□□□□□ -0.463e-10■■■■□ 25.8
PCBP2Q15366 ZNF3-210ENST00000449785 735 ntTSL 312.15□□□□□ -0.463e-10■■■■□ 25.8
PCBP2Q15366 ZNF3-209ENST00000441298 574 ntTSL 411.95□□□□□ -0.53e-10■■■■□ 25.8
PCBP2Q15366 ZNF3-205ENST00000413658 1441 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.833e-10■■■■□ 25.8
PCBP2Q15366 ZNF3-215ENST00000487620 2660 ntTSL 29.59□□□□□ -0.873e-10■■■■□ 25.8
PCBP2Q15366 ZNF3-208ENST00000428683 999 ntTSL 29.5□□□□□ -0.893e-10■■■■□ 25.8
PCBP2Q15366 ZNF3-207ENST00000424697 2718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.993e-10■■■■□ 25.8
PCBP2Q15366 ZNF3-202ENST00000299667 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.073e-10■■■■□ 25.8
PCBP2Q15366 ZNF3-203ENST00000303915 3473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.283e-10■■■■□ 25.8
PCBP2Q15366 ANGEL1-201ENST00000251089 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.571e-9■■■■□ 25.8
PCBP2Q15366 ZCCHC11-217ENST00000524582 539 ntTSL 418.7■□□□□ 0.584e-6■■■■□ 25.8
PCBP2Q15366 ZCCHC11-214ENST00000484723 2910 ntTSL 1 (best)15.86■□□□□ 0.134e-6■■■■□ 25.8
PCBP2Q15366 PLEKHA7-202ENST00000355661 4980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.322e-6■■■■□ 25.8
PCBP2Q15366 PLEKHA7-211ENST00000531066 4561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.612e-6■■■■□ 25.8
PCBP2Q15366 SPRYD3-203ENST00000547257 635 ntTSL 514.79□□□□□ -0.042e-8■■■■□ 25.8
PCBP2Q15366 TRAK1-210ENST00000613405 4672 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.366e-9■■■■□ 25.8
PCBP2Q15366 TRAK1-206ENST00000449246 3260 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.586e-9■■■■□ 25.8
PCBP2Q15366 TRAK1-202ENST00000341421 4620 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.586e-9■■■■□ 25.8
PCBP2Q15366 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.163e-6■■■■□ 25.8
PCBP2Q15366 MTHFD2-202ENST00000409601 1865 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.493e-6■■■■□ 25.8
PCBP2Q15366 MTHFD2-201ENST00000394053 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.763e-6■■■■□ 25.8
PCBP2Q15366 MTHFD2-203ENST00000409804 1757 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.023e-6■■■■□ 25.8
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