Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHI7

SLC23A1, Solute carrier family 23 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC23A1Q9UHI7 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC23A1Q9UHI7 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC23A1Q9UHI7 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC23A1Q9UHI7 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC23A1Q9UHI7 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC23A1Q9UHI7 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC23A1Q9UHI7 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC23A1Q9UHI7 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC23A1Q9UHI7 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC23A1Q9UHI7 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC23A1Q9UHI7 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC23A1Q9UHI7 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC23A1Q9UHI7 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC23A1Q9UHI7 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC23A1Q9UHI7 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC23A1Q9UHI7 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC23A1Q9UHI7 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC23A1Q9UHI7 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC23A1Q9UHI7 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC23A1Q9UHI7 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC23A1Q9UHI7 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC23A1Q9UHI7 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC23A1Q9UHI7 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC23A1Q9UHI7 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC23A1Q9UHI7 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC23A1Q9UHI7 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC23A1Q9UHI7 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC23A1Q9UHI7 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC23A1Q9UHI7 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC23A1Q9UHI7 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC23A1Q9UHI7 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC23A1Q9UHI7 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC23A1Q9UHI7 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC23A1Q9UHI7 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC23A1Q9UHI7 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC23A1Q9UHI7 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC23A1Q9UHI7 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC23A1Q9UHI7 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC23A1Q9UHI7 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC23A1Q9UHI7 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC23A1Q9UHI7 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC23A1Q9UHI7 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC23A1Q9UHI7 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC23A1Q9UHI7 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC23A1Q9UHI7 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC23A1Q9UHI7 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC23A1Q9UHI7 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC23A1Q9UHI7 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC23A1Q9UHI7 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC23A1Q9UHI7 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC23A1Q9UHI7 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC23A1Q9UHI7 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC23A1Q9UHI7 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC23A1Q9UHI7 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC23A1Q9UHI7 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC23A1Q9UHI7 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC23A1Q9UHI7 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC23A1Q9UHI7 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC23A1Q9UHI7 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC23A1Q9UHI7 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC23A1Q9UHI7 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC23A1Q9UHI7 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC23A1Q9UHI7 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC23A1Q9UHI7 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC23A1Q9UHI7 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC23A1Q9UHI7 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC23A1Q9UHI7 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC23A1Q9UHI7 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC23A1Q9UHI7 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC23A1Q9UHI7 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC23A1Q9UHI7 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC23A1Q9UHI7 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC23A1Q9UHI7 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC23A1Q9UHI7 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC23A1Q9UHI7 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC23A1Q9UHI7 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC23A1Q9UHI7 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC23A1Q9UHI7 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC23A1Q9UHI7 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC23A1Q9UHI7 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC23A1Q9UHI7 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC23A1Q9UHI7 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC23A1Q9UHI7 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC23A1Q9UHI7 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC23A1Q9UHI7 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC23A1Q9UHI7 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC23A1Q9UHI7 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC23A1Q9UHI7 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC23A1Q9UHI7 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC23A1Q9UHI7 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC23A1Q9UHI7 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC23A1Q9UHI7 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC23A1Q9UHI7 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC23A1Q9UHI7 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC23A1Q9UHI7 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC23A1Q9UHI7 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC23A1Q9UHI7 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC23A1Q9UHI7 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC23A1Q9UHI7 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC23A1Q9UHI7 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms