Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6U6

BCAS3, Breast carcinoma-amplified sequence 3, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAS3Q9H6U6 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BCAS3Q9H6U6 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms