Protein–RNA interactions for Protein: Q14126

DSG2, Desmoglein-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG2Q14126 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSG2Q14126 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSG2Q14126 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSG2Q14126 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSG2Q14126 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSG2Q14126 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSG2Q14126 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSG2Q14126 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSG2Q14126 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSG2Q14126 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSG2Q14126 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSG2Q14126 ENKUR-202ENST00000376363 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSG2Q14126 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSG2Q14126 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSG2Q14126 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSG2Q14126 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSG2Q14126 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSG2Q14126 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSG2Q14126 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSG2Q14126 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSG2Q14126 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
DSG2Q14126 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSG2Q14126 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSG2Q14126 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSG2Q14126 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSG2Q14126 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSG2Q14126 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
DSG2Q14126 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSG2Q14126 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSG2Q14126 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSG2Q14126 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSG2Q14126 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSG2Q14126 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSG2Q14126 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSG2Q14126 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
DSG2Q14126 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSG2Q14126 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSG2Q14126 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSG2Q14126 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSG2Q14126 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSG2Q14126 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSG2Q14126 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSG2Q14126 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSG2Q14126 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSG2Q14126 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSG2Q14126 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSG2Q14126 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSG2Q14126 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSG2Q14126 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSG2Q14126 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSG2Q14126 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSG2Q14126 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSG2Q14126 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSG2Q14126 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSG2Q14126 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSG2Q14126 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSG2Q14126 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSG2Q14126 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSG2Q14126 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSG2Q14126 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSG2Q14126 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSG2Q14126 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSG2Q14126 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSG2Q14126 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSG2Q14126 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSG2Q14126 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSG2Q14126 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSG2Q14126 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSG2Q14126 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSG2Q14126 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSG2Q14126 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
DSG2Q14126 AL158211.2-201ENST00000607282 395 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
DSG2Q14126 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSG2Q14126 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSG2Q14126 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSG2Q14126 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSG2Q14126 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSG2Q14126 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSG2Q14126 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
DSG2Q14126 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
DSG2Q14126 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
DSG2Q14126 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
DSG2Q14126 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
DSG2Q14126 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSG2Q14126 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSG2Q14126 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSG2Q14126 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSG2Q14126 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSG2Q14126 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSG2Q14126 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSG2Q14126 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSG2Q14126 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSG2Q14126 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSG2Q14126 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSG2Q14126 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
DSG2Q14126 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSG2Q14126 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSG2Q14126 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
DSG2Q14126 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSG2Q14126 AC109587.1-201ENST00000482368 962 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms