Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC21■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MDM2Q00987 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms