Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP107P57740 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP107P57740 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP107P57740 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP107P57740 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP107P57740 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP107P57740 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP107P57740 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP107P57740 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP107P57740 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP107P57740 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP107P57740 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP107P57740 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP107P57740 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP107P57740 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP107P57740 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP107P57740 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP107P57740 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP107P57740 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP107P57740 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP107P57740 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP107P57740 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP107P57740 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP107P57740 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP107P57740 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP107P57740 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP107P57740 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP107P57740 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP107P57740 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP107P57740 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP107P57740 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP107P57740 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP107P57740 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP107P57740 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP107P57740 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP107P57740 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP107P57740 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP107P57740 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP107P57740 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP107P57740 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP107P57740 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP107P57740 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP107P57740 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP107P57740 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP107P57740 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP107P57740 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP107P57740 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP107P57740 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP107P57740 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP107P57740 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP107P57740 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP107P57740 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP107P57740 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP107P57740 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP107P57740 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP107P57740 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP107P57740 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP107P57740 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP107P57740 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP107P57740 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP107P57740 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP107P57740 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP107P57740 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP107P57740 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP107P57740 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP107P57740 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP107P57740 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP107P57740 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP107P57740 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP107P57740 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP107P57740 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP107P57740 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP107P57740 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP107P57740 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP107P57740 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP107P57740 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP107P57740 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP107P57740 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP107P57740 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP107P57740 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP107P57740 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP107P57740 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP107P57740 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP107P57740 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP107P57740 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP107P57740 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP107P57740 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP107P57740 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP107P57740 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP107P57740 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP107P57740 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP107P57740 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP107P57740 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP107P57740 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP107P57740 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP107P57740 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP107P57740 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP107P57740 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP107P57740 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
NUP107P57740 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms