Protein–RNA interactions for Protein: P19532

TFE3, Transcription factor E3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFE3P19532 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TFE3P19532 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TFE3P19532 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TFE3P19532 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TFE3P19532 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TFE3P19532 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TFE3P19532 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TFE3P19532 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TFE3P19532 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TFE3P19532 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TFE3P19532 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TFE3P19532 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TFE3P19532 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TFE3P19532 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TFE3P19532 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TFE3P19532 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TFE3P19532 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TFE3P19532 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TFE3P19532 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TFE3P19532 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TFE3P19532 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TFE3P19532 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TFE3P19532 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TFE3P19532 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TFE3P19532 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFE3P19532 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFE3P19532 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFE3P19532 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFE3P19532 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFE3P19532 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFE3P19532 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFE3P19532 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFE3P19532 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFE3P19532 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TFE3P19532 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFE3P19532 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFE3P19532 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFE3P19532 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFE3P19532 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFE3P19532 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFE3P19532 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TFE3P19532 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFE3P19532 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFE3P19532 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFE3P19532 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFE3P19532 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFE3P19532 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFE3P19532 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFE3P19532 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TFE3P19532 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TFE3P19532 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TFE3P19532 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TFE3P19532 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TFE3P19532 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TFE3P19532 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TFE3P19532 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TFE3P19532 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TFE3P19532 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TFE3P19532 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TFE3P19532 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TFE3P19532 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TFE3P19532 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TFE3P19532 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TFE3P19532 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TFE3P19532 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TFE3P19532 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TFE3P19532 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TFE3P19532 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TFE3P19532 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TFE3P19532 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TFE3P19532 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TFE3P19532 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TFE3P19532 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TFE3P19532 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TFE3P19532 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TFE3P19532 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TFE3P19532 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TFE3P19532 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TFE3P19532 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TFE3P19532 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TFE3P19532 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TFE3P19532 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TFE3P19532 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TFE3P19532 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFE3P19532 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFE3P19532 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFE3P19532 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFE3P19532 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFE3P19532 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFE3P19532 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFE3P19532 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFE3P19532 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFE3P19532 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFE3P19532 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFE3P19532 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFE3P19532 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFE3P19532 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFE3P19532 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFE3P19532 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TFE3P19532 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms