Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.05■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00312Q9Y6C7 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms