Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV5

AMFR, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMFRQ9UKV5 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
AMFRQ9UKV5 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms