Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms