Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFNP31947 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFNP31947 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFNP31947 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFNP31947 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFNP31947 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFNP31947 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFNP31947 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFNP31947 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFNP31947 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFNP31947 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFNP31947 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFNP31947 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFNP31947 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFNP31947 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFNP31947 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFNP31947 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFNP31947 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFNP31947 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFNP31947 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFNP31947 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFNP31947 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFNP31947 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFNP31947 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SFNP31947 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFNP31947 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFNP31947 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFNP31947 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFNP31947 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFNP31947 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SFNP31947 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFNP31947 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFNP31947 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFNP31947 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SFNP31947 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SFNP31947 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SFNP31947 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SFNP31947 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SFNP31947 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
SFNP31947 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SFNP31947 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SFNP31947 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SFNP31947 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SFNP31947 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SFNP31947 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFNP31947 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFNP31947 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFNP31947 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFNP31947 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFNP31947 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFNP31947 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFNP31947 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFNP31947 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFNP31947 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFNP31947 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SFNP31947 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SFNP31947 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SFNP31947 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFNP31947 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFNP31947 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFNP31947 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFNP31947 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFNP31947 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFNP31947 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFNP31947 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFNP31947 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFNP31947 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFNP31947 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFNP31947 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFNP31947 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SFNP31947 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SFNP31947 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SFNP31947 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SFNP31947 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SFNP31947 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SFNP31947 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SFNP31947 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SFNP31947 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SFNP31947 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SFNP31947 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SFNP31947 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SFNP31947 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SFNP31947 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SFNP31947 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SFNP31947 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SFNP31947 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SFNP31947 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SFNP31947 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SFNP31947 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SFNP31947 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SFNP31947 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SFNP31947 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SFNP31947 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SFNP31947 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SFNP31947 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SFNP31947 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SFNP31947 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SFNP31947 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SFNP31947 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SFNP31947 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms