Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZBED1O96006 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZBED1O96006 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZBED1O96006 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZBED1O96006 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZBED1O96006 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZBED1O96006 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZBED1O96006 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZBED1O96006 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ZBED1O96006 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZBED1O96006 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZBED1O96006 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZBED1O96006 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZBED1O96006 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZBED1O96006 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZBED1O96006 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZBED1O96006 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZBED1O96006 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZBED1O96006 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZBED1O96006 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZBED1O96006 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZBED1O96006 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ZBED1O96006 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZBED1O96006 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZBED1O96006 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZBED1O96006 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZBED1O96006 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZBED1O96006 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZBED1O96006 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZBED1O96006 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZBED1O96006 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZBED1O96006 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZBED1O96006 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZBED1O96006 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZBED1O96006 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZBED1O96006 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZBED1O96006 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZBED1O96006 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZBED1O96006 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZBED1O96006 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZBED1O96006 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZBED1O96006 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZBED1O96006 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZBED1O96006 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZBED1O96006 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZBED1O96006 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZBED1O96006 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZBED1O96006 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZBED1O96006 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ZBED1O96006 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZBED1O96006 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ZBED1O96006 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZBED1O96006 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZBED1O96006 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZBED1O96006 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZBED1O96006 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZBED1O96006 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZBED1O96006 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZBED1O96006 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZBED1O96006 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZBED1O96006 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZBED1O96006 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZBED1O96006 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZBED1O96006 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZBED1O96006 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZBED1O96006 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZBED1O96006 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZBED1O96006 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZBED1O96006 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZBED1O96006 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
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ZBED1O96006 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZBED1O96006 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZBED1O96006 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZBED1O96006 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZBED1O96006 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZBED1O96006 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZBED1O96006 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZBED1O96006 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZBED1O96006 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZBED1O96006 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZBED1O96006 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZBED1O96006 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZBED1O96006 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZBED1O96006 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZBED1O96006 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZBED1O96006 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZBED1O96006 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZBED1O96006 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZBED1O96006 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ZBED1O96006 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ZBED1O96006 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ZBED1O96006 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZBED1O96006 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZBED1O96006 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZBED1O96006 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ZBED1O96006 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZBED1O96006 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZBED1O96006 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZBED1O96006 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
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