Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SIN3BO75182 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SIN3BO75182 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SIN3BO75182 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SIN3BO75182 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SIN3BO75182 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SIN3BO75182 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SIN3BO75182 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SIN3BO75182 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SIN3BO75182 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SIN3BO75182 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SIN3BO75182 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SIN3BO75182 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SIN3BO75182 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SIN3BO75182 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SIN3BO75182 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SIN3BO75182 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SIN3BO75182 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SIN3BO75182 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SIN3BO75182 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SIN3BO75182 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SIN3BO75182 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SIN3BO75182 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SIN3BO75182 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SIN3BO75182 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SIN3BO75182 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SIN3BO75182 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SIN3BO75182 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SIN3BO75182 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SIN3BO75182 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SIN3BO75182 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SIN3BO75182 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SIN3BO75182 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SIN3BO75182 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SIN3BO75182 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SIN3BO75182 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SIN3BO75182 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SIN3BO75182 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SIN3BO75182 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SIN3BO75182 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SIN3BO75182 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SIN3BO75182 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SIN3BO75182 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SIN3BO75182 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SIN3BO75182 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SIN3BO75182 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SIN3BO75182 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SIN3BO75182 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SIN3BO75182 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SIN3BO75182 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SIN3BO75182 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SIN3BO75182 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SIN3BO75182 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SIN3BO75182 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SIN3BO75182 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SIN3BO75182 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SIN3BO75182 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SIN3BO75182 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SIN3BO75182 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SIN3BO75182 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SIN3BO75182 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SIN3BO75182 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SIN3BO75182 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SIN3BO75182 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SIN3BO75182 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SIN3BO75182 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SIN3BO75182 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SIN3BO75182 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SIN3BO75182 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SIN3BO75182 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SIN3BO75182 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SIN3BO75182 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SIN3BO75182 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms