Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FAM53CQ9NYF3 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
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