Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5D6

GBGT1, Globoside alpha-1,3-N-acetylgalactosaminyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBGT1Q8N5D6 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GBGT1Q8N5D6 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GBGT1Q8N5D6 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GBGT1Q8N5D6 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GBGT1Q8N5D6 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GBGT1Q8N5D6 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GBGT1Q8N5D6 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GBGT1Q8N5D6 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GBGT1Q8N5D6 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GBGT1Q8N5D6 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GBGT1Q8N5D6 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GBGT1Q8N5D6 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GBGT1Q8N5D6 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GBGT1Q8N5D6 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GBGT1Q8N5D6 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GBGT1Q8N5D6 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GBGT1Q8N5D6 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GBGT1Q8N5D6 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GBGT1Q8N5D6 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GBGT1Q8N5D6 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GBGT1Q8N5D6 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GBGT1Q8N5D6 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GBGT1Q8N5D6 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GBGT1Q8N5D6 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GBGT1Q8N5D6 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GBGT1Q8N5D6 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GBGT1Q8N5D6 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GBGT1Q8N5D6 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GBGT1Q8N5D6 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GBGT1Q8N5D6 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GBGT1Q8N5D6 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GBGT1Q8N5D6 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GBGT1Q8N5D6 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GBGT1Q8N5D6 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GBGT1Q8N5D6 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GBGT1Q8N5D6 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GBGT1Q8N5D6 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GBGT1Q8N5D6 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GBGT1Q8N5D6 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GBGT1Q8N5D6 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GBGT1Q8N5D6 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GBGT1Q8N5D6 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GBGT1Q8N5D6 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GBGT1Q8N5D6 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GBGT1Q8N5D6 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GBGT1Q8N5D6 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GBGT1Q8N5D6 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GBGT1Q8N5D6 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GBGT1Q8N5D6 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GBGT1Q8N5D6 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
GBGT1Q8N5D6 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GBGT1Q8N5D6 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GBGT1Q8N5D6 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GBGT1Q8N5D6 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GBGT1Q8N5D6 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GBGT1Q8N5D6 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GBGT1Q8N5D6 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GBGT1Q8N5D6 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
GBGT1Q8N5D6 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GBGT1Q8N5D6 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GBGT1Q8N5D6 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GBGT1Q8N5D6 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
GBGT1Q8N5D6 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
GBGT1Q8N5D6 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GBGT1Q8N5D6 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GBGT1Q8N5D6 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GBGT1Q8N5D6 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GBGT1Q8N5D6 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GBGT1Q8N5D6 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GBGT1Q8N5D6 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GBGT1Q8N5D6 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GBGT1Q8N5D6 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GBGT1Q8N5D6 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GBGT1Q8N5D6 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GBGT1Q8N5D6 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GBGT1Q8N5D6 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GBGT1Q8N5D6 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GBGT1Q8N5D6 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GBGT1Q8N5D6 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GBGT1Q8N5D6 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GBGT1Q8N5D6 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
GBGT1Q8N5D6 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GBGT1Q8N5D6 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GBGT1Q8N5D6 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GBGT1Q8N5D6 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GBGT1Q8N5D6 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
GBGT1Q8N5D6 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GBGT1Q8N5D6 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GBGT1Q8N5D6 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GBGT1Q8N5D6 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GBGT1Q8N5D6 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GBGT1Q8N5D6 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GBGT1Q8N5D6 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GBGT1Q8N5D6 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GBGT1Q8N5D6 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GBGT1Q8N5D6 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GBGT1Q8N5D6 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GBGT1Q8N5D6 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GBGT1Q8N5D6 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GBGT1Q8N5D6 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms