Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms