Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SGCBQ16585 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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SGCBQ16585 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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SGCBQ16585 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
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SGCBQ16585 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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SGCBQ16585 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGCBQ16585 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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