Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CENPCQ03188 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms