Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBB2BQ9BVA1 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBB2BQ9BVA1 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBB2BQ9BVA1 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBB2BQ9BVA1 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBB2BQ9BVA1 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBB2BQ9BVA1 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBB2BQ9BVA1 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBB2BQ9BVA1 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBB2BQ9BVA1 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBB2BQ9BVA1 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBB2BQ9BVA1 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBB2BQ9BVA1 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBB2BQ9BVA1 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBB2BQ9BVA1 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBB2BQ9BVA1 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBB2BQ9BVA1 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBB2BQ9BVA1 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBB2BQ9BVA1 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBB2BQ9BVA1 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBB2BQ9BVA1 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBB2BQ9BVA1 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBB2BQ9BVA1 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBB2BQ9BVA1 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBB2BQ9BVA1 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBB2BQ9BVA1 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBB2BQ9BVA1 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBB2BQ9BVA1 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBB2BQ9BVA1 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBB2BQ9BVA1 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBB2BQ9BVA1 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBB2BQ9BVA1 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBB2BQ9BVA1 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBB2BQ9BVA1 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBB2BQ9BVA1 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBB2BQ9BVA1 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBB2BQ9BVA1 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBB2BQ9BVA1 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBB2BQ9BVA1 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBB2BQ9BVA1 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBB2BQ9BVA1 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBB2BQ9BVA1 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBB2BQ9BVA1 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBB2BQ9BVA1 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBB2BQ9BVA1 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBB2BQ9BVA1 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBB2BQ9BVA1 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBB2BQ9BVA1 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBB2BQ9BVA1 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBB2BQ9BVA1 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBB2BQ9BVA1 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBB2BQ9BVA1 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBB2BQ9BVA1 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBB2BQ9BVA1 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBB2BQ9BVA1 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBB2BQ9BVA1 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBB2BQ9BVA1 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBB2BQ9BVA1 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBB2BQ9BVA1 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBB2BQ9BVA1 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBB2BQ9BVA1 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBB2BQ9BVA1 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBB2BQ9BVA1 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBB2BQ9BVA1 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBB2BQ9BVA1 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBB2BQ9BVA1 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBB2BQ9BVA1 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBB2BQ9BVA1 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBB2BQ9BVA1 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBB2BQ9BVA1 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBB2BQ9BVA1 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBB2BQ9BVA1 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBB2BQ9BVA1 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBB2BQ9BVA1 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBB2BQ9BVA1 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBB2BQ9BVA1 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBB2BQ9BVA1 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBB2BQ9BVA1 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBB2BQ9BVA1 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBB2BQ9BVA1 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBB2BQ9BVA1 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBB2BQ9BVA1 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBB2BQ9BVA1 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBB2BQ9BVA1 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBB2BQ9BVA1 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBB2BQ9BVA1 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBB2BQ9BVA1 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBB2BQ9BVA1 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBB2BQ9BVA1 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBB2BQ9BVA1 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBB2BQ9BVA1 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBB2BQ9BVA1 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBB2BQ9BVA1 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBB2BQ9BVA1 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBB2BQ9BVA1 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBB2BQ9BVA1 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBB2BQ9BVA1 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBB2BQ9BVA1 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBB2BQ9BVA1 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBB2BQ9BVA1 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms