Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC8.88□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 AC011700.1-201ENST00000610409 2627 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 LOXL4-201ENST00000260702 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 CREBL2-201ENST00000228865 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC8.88□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 PPCDC-201ENST00000342932 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms