Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms