Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
EFHD1Q9BUP0 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms