Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms