Protein–RNA interactions for Protein: P55854

SUMO3, Small ubiquitin-related modifier 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3P55854 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SUMO3P55854 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SUMO3P55854 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SUMO3P55854 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SUMO3P55854 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SUMO3P55854 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SUMO3P55854 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SUMO3P55854 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SUMO3P55854 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SUMO3P55854 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SUMO3P55854 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SUMO3P55854 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SUMO3P55854 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUMO3P55854 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUMO3P55854 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUMO3P55854 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUMO3P55854 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUMO3P55854 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUMO3P55854 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUMO3P55854 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUMO3P55854 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUMO3P55854 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SUMO3P55854 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUMO3P55854 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUMO3P55854 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUMO3P55854 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUMO3P55854 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUMO3P55854 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SUMO3P55854 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUMO3P55854 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUMO3P55854 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUMO3P55854 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUMO3P55854 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SUMO3P55854 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUMO3P55854 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUMO3P55854 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SUMO3P55854 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUMO3P55854 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUMO3P55854 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUMO3P55854 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUMO3P55854 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUMO3P55854 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUMO3P55854 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUMO3P55854 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUMO3P55854 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUMO3P55854 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUMO3P55854 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUMO3P55854 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SUMO3P55854 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SUMO3P55854 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SUMO3P55854 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SUMO3P55854 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms