Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HACD1B0YJ81 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HACD1B0YJ81 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HACD1B0YJ81 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HACD1B0YJ81 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
HACD1B0YJ81 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HACD1B0YJ81 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HACD1B0YJ81 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HACD1B0YJ81 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HACD1B0YJ81 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HACD1B0YJ81 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
HACD1B0YJ81 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HACD1B0YJ81 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HACD1B0YJ81 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HACD1B0YJ81 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HACD1B0YJ81 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HACD1B0YJ81 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HACD1B0YJ81 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms