Protein–RNA interactions for Protein: A8MVJ9

Putative histone PARylation factor 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MVJ9 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
A8MVJ9 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
A8MVJ9 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
A8MVJ9 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
A8MVJ9 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
A8MVJ9 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
A8MVJ9 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
A8MVJ9 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
A8MVJ9 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
A8MVJ9 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
A8MVJ9 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
A8MVJ9 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
A8MVJ9 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
A8MVJ9 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
A8MVJ9 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
A8MVJ9 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
A8MVJ9 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
A8MVJ9 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
A8MVJ9 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
A8MVJ9 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
A8MVJ9 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
A8MVJ9 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
A8MVJ9 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
A8MVJ9 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
A8MVJ9 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
A8MVJ9 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
A8MVJ9 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
A8MVJ9 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
A8MVJ9 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
A8MVJ9 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
A8MVJ9 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
A8MVJ9 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
A8MVJ9 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
A8MVJ9 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
A8MVJ9 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
A8MVJ9 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
A8MVJ9 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
A8MVJ9 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
A8MVJ9 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
A8MVJ9 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
A8MVJ9 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
A8MVJ9 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
A8MVJ9 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
A8MVJ9 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
A8MVJ9 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
A8MVJ9 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
A8MVJ9 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
A8MVJ9 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
A8MVJ9 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
A8MVJ9 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
A8MVJ9 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
A8MVJ9 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
A8MVJ9 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
A8MVJ9 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
A8MVJ9 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
A8MVJ9 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
A8MVJ9 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
A8MVJ9 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
A8MVJ9 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
A8MVJ9 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
A8MVJ9 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
A8MVJ9 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
A8MVJ9 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
A8MVJ9 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
A8MVJ9 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
A8MVJ9 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
A8MVJ9 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
A8MVJ9 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
A8MVJ9 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
A8MVJ9 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
A8MVJ9 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
A8MVJ9 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
A8MVJ9 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
A8MVJ9 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
A8MVJ9 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
A8MVJ9 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
A8MVJ9 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
A8MVJ9 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
A8MVJ9 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
A8MVJ9 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
A8MVJ9 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
A8MVJ9 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
A8MVJ9 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
A8MVJ9 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
A8MVJ9 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
A8MVJ9 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
A8MVJ9 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
A8MVJ9 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
A8MVJ9 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
A8MVJ9 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
A8MVJ9 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
A8MVJ9 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
A8MVJ9 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
A8MVJ9 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
A8MVJ9 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
A8MVJ9 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
A8MVJ9 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
A8MVJ9 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
A8MVJ9 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
A8MVJ9 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms