Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTF3C3Q9Y5Q9 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF3C3Q9Y5Q9 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms