Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms