Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC4

ZNF479, Zinc finger protein 479, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF479Q96JC4 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF479Q96JC4 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF479Q96JC4 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF479Q96JC4 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF479Q96JC4 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF479Q96JC4 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF479Q96JC4 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF479Q96JC4 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF479Q96JC4 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF479Q96JC4 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF479Q96JC4 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF479Q96JC4 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF479Q96JC4 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF479Q96JC4 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF479Q96JC4 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF479Q96JC4 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF479Q96JC4 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF479Q96JC4 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF479Q96JC4 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF479Q96JC4 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF479Q96JC4 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF479Q96JC4 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF479Q96JC4 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF479Q96JC4 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF479Q96JC4 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF479Q96JC4 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF479Q96JC4 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF479Q96JC4 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF479Q96JC4 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF479Q96JC4 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF479Q96JC4 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF479Q96JC4 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF479Q96JC4 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF479Q96JC4 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF479Q96JC4 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF479Q96JC4 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF479Q96JC4 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF479Q96JC4 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF479Q96JC4 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF479Q96JC4 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF479Q96JC4 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF479Q96JC4 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF479Q96JC4 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF479Q96JC4 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF479Q96JC4 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF479Q96JC4 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF479Q96JC4 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF479Q96JC4 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF479Q96JC4 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF479Q96JC4 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF479Q96JC4 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF479Q96JC4 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF479Q96JC4 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF479Q96JC4 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF479Q96JC4 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF479Q96JC4 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF479Q96JC4 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF479Q96JC4 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF479Q96JC4 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF479Q96JC4 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF479Q96JC4 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF479Q96JC4 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF479Q96JC4 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF479Q96JC4 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF479Q96JC4 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF479Q96JC4 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF479Q96JC4 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF479Q96JC4 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF479Q96JC4 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF479Q96JC4 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF479Q96JC4 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF479Q96JC4 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF479Q96JC4 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF479Q96JC4 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF479Q96JC4 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF479Q96JC4 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF479Q96JC4 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF479Q96JC4 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF479Q96JC4 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF479Q96JC4 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF479Q96JC4 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF479Q96JC4 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF479Q96JC4 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF479Q96JC4 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF479Q96JC4 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF479Q96JC4 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF479Q96JC4 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF479Q96JC4 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF479Q96JC4 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF479Q96JC4 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF479Q96JC4 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF479Q96JC4 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF479Q96JC4 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF479Q96JC4 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF479Q96JC4 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF479Q96JC4 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF479Q96JC4 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF479Q96JC4 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF479Q96JC4 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF479Q96JC4 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms