Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms