Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RABGGTAQ92696 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
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