Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BEST4Q8NFU0 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BEST4Q8NFU0 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BEST4Q8NFU0 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BEST4Q8NFU0 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BEST4Q8NFU0 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BEST4Q8NFU0 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BEST4Q8NFU0 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BEST4Q8NFU0 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BEST4Q8NFU0 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BEST4Q8NFU0 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BEST4Q8NFU0 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BEST4Q8NFU0 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BEST4Q8NFU0 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BEST4Q8NFU0 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BEST4Q8NFU0 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BEST4Q8NFU0 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BEST4Q8NFU0 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BEST4Q8NFU0 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BEST4Q8NFU0 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BEST4Q8NFU0 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BEST4Q8NFU0 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BEST4Q8NFU0 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BEST4Q8NFU0 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BEST4Q8NFU0 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BEST4Q8NFU0 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BEST4Q8NFU0 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BEST4Q8NFU0 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BEST4Q8NFU0 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BEST4Q8NFU0 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BEST4Q8NFU0 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BEST4Q8NFU0 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
BEST4Q8NFU0 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BEST4Q8NFU0 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BEST4Q8NFU0 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BEST4Q8NFU0 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BEST4Q8NFU0 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BEST4Q8NFU0 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BEST4Q8NFU0 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BEST4Q8NFU0 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BEST4Q8NFU0 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BEST4Q8NFU0 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BEST4Q8NFU0 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BEST4Q8NFU0 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BEST4Q8NFU0 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BEST4Q8NFU0 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BEST4Q8NFU0 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BEST4Q8NFU0 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
BEST4Q8NFU0 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BEST4Q8NFU0 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BEST4Q8NFU0 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BEST4Q8NFU0 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BEST4Q8NFU0 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BEST4Q8NFU0 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BEST4Q8NFU0 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
BEST4Q8NFU0 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BEST4Q8NFU0 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BEST4Q8NFU0 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BEST4Q8NFU0 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BEST4Q8NFU0 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BEST4Q8NFU0 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BEST4Q8NFU0 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BEST4Q8NFU0 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BEST4Q8NFU0 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BEST4Q8NFU0 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BEST4Q8NFU0 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BEST4Q8NFU0 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BEST4Q8NFU0 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BEST4Q8NFU0 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BEST4Q8NFU0 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BEST4Q8NFU0 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BEST4Q8NFU0 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BEST4Q8NFU0 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BEST4Q8NFU0 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BEST4Q8NFU0 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BEST4Q8NFU0 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BEST4Q8NFU0 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BEST4Q8NFU0 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BEST4Q8NFU0 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BEST4Q8NFU0 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BEST4Q8NFU0 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BEST4Q8NFU0 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BEST4Q8NFU0 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BEST4Q8NFU0 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BEST4Q8NFU0 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BEST4Q8NFU0 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
BEST4Q8NFU0 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BEST4Q8NFU0 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BEST4Q8NFU0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BEST4Q8NFU0 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BEST4Q8NFU0 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
BEST4Q8NFU0 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BEST4Q8NFU0 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BEST4Q8NFU0 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BEST4Q8NFU0 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms