Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TLR1Q15399 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TLR1Q15399 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TLR1Q15399 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TLR1Q15399 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TLR1Q15399 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TLR1Q15399 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TLR1Q15399 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TLR1Q15399 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TLR1Q15399 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TLR1Q15399 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TLR1Q15399 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TLR1Q15399 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TLR1Q15399 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TLR1Q15399 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TLR1Q15399 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TLR1Q15399 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TLR1Q15399 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TLR1Q15399 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TLR1Q15399 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TLR1Q15399 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TLR1Q15399 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TLR1Q15399 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TLR1Q15399 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TLR1Q15399 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TLR1Q15399 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TLR1Q15399 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TLR1Q15399 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TLR1Q15399 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TLR1Q15399 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TLR1Q15399 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TLR1Q15399 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TLR1Q15399 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TLR1Q15399 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TLR1Q15399 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TLR1Q15399 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TLR1Q15399 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TLR1Q15399 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TLR1Q15399 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TLR1Q15399 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TLR1Q15399 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TLR1Q15399 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TLR1Q15399 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TLR1Q15399 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TLR1Q15399 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TLR1Q15399 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TLR1Q15399 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TLR1Q15399 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TLR1Q15399 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TLR1Q15399 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TLR1Q15399 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TLR1Q15399 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TLR1Q15399 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TLR1Q15399 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TLR1Q15399 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TLR1Q15399 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TLR1Q15399 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TLR1Q15399 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TLR1Q15399 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TLR1Q15399 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TLR1Q15399 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TLR1Q15399 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TLR1Q15399 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TLR1Q15399 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TLR1Q15399 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TLR1Q15399 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TLR1Q15399 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TLR1Q15399 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TLR1Q15399 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TLR1Q15399 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TLR1Q15399 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TLR1Q15399 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TLR1Q15399 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TLR1Q15399 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TLR1Q15399 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TLR1Q15399 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TLR1Q15399 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TLR1Q15399 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TLR1Q15399 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TLR1Q15399 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TLR1Q15399 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TLR1Q15399 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TLR1Q15399 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TLR1Q15399 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TLR1Q15399 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TLR1Q15399 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TLR1Q15399 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TLR1Q15399 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TLR1Q15399 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TLR1Q15399 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TLR1Q15399 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TLR1Q15399 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TLR1Q15399 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TLR1Q15399 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TLR1Q15399 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TLR1Q15399 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TLR1Q15399 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TLR1Q15399 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TLR1Q15399 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TLR1Q15399 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms