Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EXOSC10Q01780 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms