Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COPAP53621 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COPAP53621 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COPAP53621 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COPAP53621 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COPAP53621 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COPAP53621 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COPAP53621 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COPAP53621 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COPAP53621 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COPAP53621 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COPAP53621 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COPAP53621 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COPAP53621 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COPAP53621 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COPAP53621 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COPAP53621 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COPAP53621 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COPAP53621 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COPAP53621 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COPAP53621 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COPAP53621 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COPAP53621 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COPAP53621 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COPAP53621 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
COPAP53621 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COPAP53621 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COPAP53621 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COPAP53621 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COPAP53621 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COPAP53621 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COPAP53621 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COPAP53621 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COPAP53621 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COPAP53621 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COPAP53621 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COPAP53621 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COPAP53621 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COPAP53621 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COPAP53621 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COPAP53621 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COPAP53621 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COPAP53621 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COPAP53621 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COPAP53621 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
COPAP53621 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COPAP53621 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COPAP53621 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COPAP53621 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COPAP53621 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COPAP53621 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COPAP53621 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COPAP53621 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COPAP53621 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COPAP53621 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COPAP53621 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COPAP53621 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COPAP53621 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COPAP53621 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COPAP53621 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
COPAP53621 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
COPAP53621 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COPAP53621 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COPAP53621 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COPAP53621 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COPAP53621 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COPAP53621 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COPAP53621 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
COPAP53621 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COPAP53621 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COPAP53621 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COPAP53621 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COPAP53621 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COPAP53621 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COPAP53621 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COPAP53621 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COPAP53621 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COPAP53621 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COPAP53621 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COPAP53621 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COPAP53621 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COPAP53621 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COPAP53621 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COPAP53621 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COPAP53621 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COPAP53621 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COPAP53621 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COPAP53621 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COPAP53621 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COPAP53621 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
COPAP53621 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COPAP53621 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
COPAP53621 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COPAP53621 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COPAP53621 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COPAP53621 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COPAP53621 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COPAP53621 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COPAP53621 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COPAP53621 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms