Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMPOP42166 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMPOP42166 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMPOP42166 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMPOP42166 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMPOP42166 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMPOP42166 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMPOP42166 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMPOP42166 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TMPOP42166 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMPOP42166 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMPOP42166 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMPOP42166 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TMPOP42166 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMPOP42166 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TMPOP42166 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMPOP42166 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMPOP42166 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMPOP42166 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMPOP42166 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMPOP42166 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMPOP42166 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMPOP42166 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMPOP42166 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMPOP42166 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMPOP42166 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMPOP42166 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TMPOP42166 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TMPOP42166 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMPOP42166 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMPOP42166 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMPOP42166 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMPOP42166 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMPOP42166 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMPOP42166 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMPOP42166 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMPOP42166 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TMPOP42166 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMPOP42166 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMPOP42166 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMPOP42166 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMPOP42166 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMPOP42166 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMPOP42166 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMPOP42166 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMPOP42166 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMPOP42166 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMPOP42166 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMPOP42166 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMPOP42166 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMPOP42166 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMPOP42166 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMPOP42166 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMPOP42166 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMPOP42166 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMPOP42166 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMPOP42166 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMPOP42166 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMPOP42166 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMPOP42166 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMPOP42166 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMPOP42166 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMPOP42166 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMPOP42166 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMPOP42166 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMPOP42166 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMPOP42166 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMPOP42166 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMPOP42166 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TMPOP42166 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMPOP42166 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMPOP42166 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMPOP42166 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMPOP42166 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMPOP42166 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMPOP42166 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMPOP42166 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMPOP42166 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMPOP42166 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMPOP42166 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMPOP42166 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TMPOP42166 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMPOP42166 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMPOP42166 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMPOP42166 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMPOP42166 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMPOP42166 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMPOP42166 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMPOP42166 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMPOP42166 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMPOP42166 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMPOP42166 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMPOP42166 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMPOP42166 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMPOP42166 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMPOP42166 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TMPOP42166 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMPOP42166 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMPOP42166 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMPOP42166 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms