Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK5

SDF4, 45 kDa calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDF4Q9BRK5 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms