Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
HSPB3Q12988 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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