Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

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Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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