Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDC27P30260 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDC27P30260 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDC27P30260 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDC27P30260 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CDC27P30260 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDC27P30260 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDC27P30260 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDC27P30260 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDC27P30260 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDC27P30260 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDC27P30260 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDC27P30260 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDC27P30260 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDC27P30260 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDC27P30260 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CDC27P30260 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDC27P30260 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDC27P30260 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDC27P30260 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CDC27P30260 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDC27P30260 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDC27P30260 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDC27P30260 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDC27P30260 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDC27P30260 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDC27P30260 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDC27P30260 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDC27P30260 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDC27P30260 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDC27P30260 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDC27P30260 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDC27P30260 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDC27P30260 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDC27P30260 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDC27P30260 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDC27P30260 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDC27P30260 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDC27P30260 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CDC27P30260 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDC27P30260 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDC27P30260 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDC27P30260 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDC27P30260 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDC27P30260 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDC27P30260 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDC27P30260 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDC27P30260 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDC27P30260 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDC27P30260 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDC27P30260 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDC27P30260 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDC27P30260 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDC27P30260 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDC27P30260 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDC27P30260 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDC27P30260 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDC27P30260 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDC27P30260 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDC27P30260 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDC27P30260 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDC27P30260 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDC27P30260 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDC27P30260 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDC27P30260 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDC27P30260 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDC27P30260 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDC27P30260 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDC27P30260 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDC27P30260 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDC27P30260 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDC27P30260 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDC27P30260 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CDC27P30260 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDC27P30260 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDC27P30260 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDC27P30260 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC27P30260 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC27P30260 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC27P30260 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC27P30260 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC27P30260 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC27P30260 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC27P30260 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC27P30260 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC27P30260 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC27P30260 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC27P30260 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC27P30260 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC27P30260 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC27P30260 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC27P30260 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC27P30260 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC27P30260 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC27P30260 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC27P30260 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC27P30260 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC27P30260 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC27P30260 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC27P30260 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms