Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6N6

LAMC3, Laminin subunit gamma-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC3Q9Y6N6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.33■■■■■ 4.69
LAMC3Q9Y6N6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC44.33■■■■■ 4.69
LAMC3Q9Y6N6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.69
LAMC3Q9Y6N6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC44.32■■■■■ 4.69
LAMC3Q9Y6N6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.32■■■■■ 4.69
LAMC3Q9Y6N6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC44.31■■■■■ 4.68
LAMC3Q9Y6N6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.31■■■■■ 4.68
LAMC3Q9Y6N6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC44.31■■■■■ 4.68
LAMC3Q9Y6N6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC44.31■■■■■ 4.68
LAMC3Q9Y6N6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC44.31■■■■■ 4.68
LAMC3Q9Y6N6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC44.31■■■■■ 4.68
LAMC3Q9Y6N6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.3■■■■■ 4.68
LAMC3Q9Y6N6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC44.3■■■■■ 4.68
LAMC3Q9Y6N6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.29■■■■■ 4.68
LAMC3Q9Y6N6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC44.29■■■■■ 4.68
LAMC3Q9Y6N6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.29■■■■■ 4.68
LAMC3Q9Y6N6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC44.28■■■■■ 4.68
LAMC3Q9Y6N6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC44.28■■■■■ 4.68
LAMC3Q9Y6N6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.28■■■■■ 4.68
LAMC3Q9Y6N6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.27■■■■■ 4.68
LAMC3Q9Y6N6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.27■■■■■ 4.68
LAMC3Q9Y6N6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.27■■■■■ 4.68
LAMC3Q9Y6N6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
LAMC3Q9Y6N6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC44.26■■■■■ 4.68
LAMC3Q9Y6N6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
LAMC3Q9Y6N6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC44.24■■■■■ 4.67
LAMC3Q9Y6N6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC44.24■■■■■ 4.67
LAMC3Q9Y6N6 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
LAMC3Q9Y6N6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
LAMC3Q9Y6N6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC44.23■■■■■ 4.67
LAMC3Q9Y6N6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC44.23■■■■■ 4.67
LAMC3Q9Y6N6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
LAMC3Q9Y6N6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC44.23■■■■■ 4.67
LAMC3Q9Y6N6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
LAMC3Q9Y6N6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC44.22■■■■■ 4.67
LAMC3Q9Y6N6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.22■■■■■ 4.67
LAMC3Q9Y6N6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC44.21■■■■■ 4.67
LAMC3Q9Y6N6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC44.21■■■■■ 4.67
LAMC3Q9Y6N6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC44.2■■■■■ 4.67
LAMC3Q9Y6N6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.2■■■■■ 4.67
LAMC3Q9Y6N6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC44.2■■■■■ 4.67
LAMC3Q9Y6N6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC44.2■■■■■ 4.67
LAMC3Q9Y6N6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.19■■■■■ 4.66
LAMC3Q9Y6N6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC44.18■■■■■ 4.66
LAMC3Q9Y6N6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC44.18■■■■■ 4.66
LAMC3Q9Y6N6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.18■■■■■ 4.66
LAMC3Q9Y6N6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.18■■■■■ 4.66
LAMC3Q9Y6N6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC44.18■■■■■ 4.66
LAMC3Q9Y6N6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.17■■■■■ 4.66
LAMC3Q9Y6N6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.16■■■■■ 4.66
LAMC3Q9Y6N6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC44.16■■■■■ 4.66
LAMC3Q9Y6N6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC44.16■■■■■ 4.66
LAMC3Q9Y6N6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.16■■■■■ 4.66
LAMC3Q9Y6N6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.14■■■■■ 4.66
LAMC3Q9Y6N6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC44.14■■■■■ 4.66
LAMC3Q9Y6N6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.14■■■■■ 4.66
LAMC3Q9Y6N6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC44.13■■■■■ 4.65
LAMC3Q9Y6N6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.12■■■■■ 4.65
LAMC3Q9Y6N6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.12■■■■■ 4.65
LAMC3Q9Y6N6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC44.12■■■■■ 4.65
LAMC3Q9Y6N6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
LAMC3Q9Y6N6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC44.11■■■■■ 4.65
LAMC3Q9Y6N6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
LAMC3Q9Y6N6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.11■■■■■ 4.65
LAMC3Q9Y6N6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC44.09■■■■■ 4.65
LAMC3Q9Y6N6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.09■■■■■ 4.65
LAMC3Q9Y6N6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.09■■■■■ 4.65
LAMC3Q9Y6N6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC44.09■■■■■ 4.65
LAMC3Q9Y6N6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.09■■■■■ 4.65
LAMC3Q9Y6N6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC44.08■■■■■ 4.65
LAMC3Q9Y6N6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.08■■■■■ 4.65
LAMC3Q9Y6N6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC44.08■■■■■ 4.65
LAMC3Q9Y6N6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC44.08■■■■■ 4.65
LAMC3Q9Y6N6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC44.08■■■■■ 4.65
LAMC3Q9Y6N6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.08■■■■■ 4.65
LAMC3Q9Y6N6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC44.08■■■■■ 4.65
LAMC3Q9Y6N6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.07■■■■■ 4.65
LAMC3Q9Y6N6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC44.07■■■■■ 4.65
LAMC3Q9Y6N6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC44.07■■■■■ 4.65
LAMC3Q9Y6N6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
LAMC3Q9Y6N6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC44.06■■■■■ 4.64
LAMC3Q9Y6N6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
LAMC3Q9Y6N6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
LAMC3Q9Y6N6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
LAMC3Q9Y6N6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC44.05■■■■■ 4.64
LAMC3Q9Y6N6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.05■■■■■ 4.64
LAMC3Q9Y6N6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.05■■■■■ 4.64
LAMC3Q9Y6N6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC44.03■■■■■ 4.64
LAMC3Q9Y6N6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC44.02■■■■■ 4.64
LAMC3Q9Y6N6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC44.01■■■■■ 4.64
LAMC3Q9Y6N6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC44.01■■■■■ 4.64
LAMC3Q9Y6N6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
LAMC3Q9Y6N6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC43.99■■■■■ 4.63
LAMC3Q9Y6N6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC43.99■■■■■ 4.63
LAMC3Q9Y6N6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC43.99■■■■■ 4.63
LAMC3Q9Y6N6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.99■■■■■ 4.63
LAMC3Q9Y6N6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC43.97■■■■■ 4.63
LAMC3Q9Y6N6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
LAMC3Q9Y6N6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
LAMC3Q9Y6N6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms