Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5G9

PCDHGA4, Protocadherin gamma-A4, humanhuman

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHGA4Q9Y5G9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCDHGA4Q9Y5G9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCDHGA4Q9Y5G9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PCDHGA4Q9Y5G9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDHGA4Q9Y5G9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDHGA4Q9Y5G9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDHGA4Q9Y5G9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDHGA4Q9Y5G9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDHGA4Q9Y5G9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDHGA4Q9Y5G9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDHGA4Q9Y5G9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDHGA4Q9Y5G9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCDHGA4Q9Y5G9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCDHGA4Q9Y5G9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCDHGA4Q9Y5G9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCDHGA4Q9Y5G9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCDHGA4Q9Y5G9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCDHGA4Q9Y5G9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PCDHGA4Q9Y5G9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCDHGA4Q9Y5G9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PCDHGA4Q9Y5G9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PCDHGA4Q9Y5G9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDHGA4Q9Y5G9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDHGA4Q9Y5G9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDHGA4Q9Y5G9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDHGA4Q9Y5G9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDHGA4Q9Y5G9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHGA4Q9Y5G9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHGA4Q9Y5G9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHGA4Q9Y5G9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHGA4Q9Y5G9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHGA4Q9Y5G9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHGA4Q9Y5G9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHGA4Q9Y5G9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHGA4Q9Y5G9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHGA4Q9Y5G9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHGA4Q9Y5G9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHGA4Q9Y5G9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHGA4Q9Y5G9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDHGA4Q9Y5G9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDHGA4Q9Y5G9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDHGA4Q9Y5G9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDHGA4Q9Y5G9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDHGA4Q9Y5G9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDHGA4Q9Y5G9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDHGA4Q9Y5G9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDHGA4Q9Y5G9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDHGA4Q9Y5G9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHGA4Q9Y5G9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHGA4Q9Y5G9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHGA4Q9Y5G9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHGA4Q9Y5G9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHGA4Q9Y5G9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHGA4Q9Y5G9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHGA4Q9Y5G9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHGA4Q9Y5G9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHGA4Q9Y5G9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHGA4Q9Y5G9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHGA4Q9Y5G9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHGA4Q9Y5G9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHGA4Q9Y5G9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHGA4Q9Y5G9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHGA4Q9Y5G9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHGA4Q9Y5G9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHGA4Q9Y5G9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHGA4Q9Y5G9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHGA4Q9Y5G9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHGA4Q9Y5G9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHGA4Q9Y5G9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHGA4Q9Y5G9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHGA4Q9Y5G9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHGA4Q9Y5G9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHGA4Q9Y5G9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHGA4Q9Y5G9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHGA4Q9Y5G9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHGA4Q9Y5G9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHGA4Q9Y5G9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHGA4Q9Y5G9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHGA4Q9Y5G9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PCDHGA4Q9Y5G9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHGA4Q9Y5G9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHGA4Q9Y5G9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHGA4Q9Y5G9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHGA4Q9Y5G9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHGA4Q9Y5G9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHGA4Q9Y5G9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHGA4Q9Y5G9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHGA4Q9Y5G9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHGA4Q9Y5G9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHGA4Q9Y5G9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHGA4Q9Y5G9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHGA4Q9Y5G9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHGA4Q9Y5G9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHGA4Q9Y5G9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHGA4Q9Y5G9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHGA4Q9Y5G9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHGA4Q9Y5G9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHGA4Q9Y5G9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHGA4Q9Y5G9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHGA4Q9Y5G9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms