Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y2

CHTOP, Chromatin target of PRMT1 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTOPQ9Y3Y2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHTOPQ9Y3Y2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHTOPQ9Y3Y2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHTOPQ9Y3Y2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHTOPQ9Y3Y2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHTOPQ9Y3Y2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHTOPQ9Y3Y2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHTOPQ9Y3Y2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHTOPQ9Y3Y2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHTOPQ9Y3Y2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHTOPQ9Y3Y2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHTOPQ9Y3Y2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHTOPQ9Y3Y2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHTOPQ9Y3Y2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHTOPQ9Y3Y2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHTOPQ9Y3Y2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHTOPQ9Y3Y2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHTOPQ9Y3Y2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHTOPQ9Y3Y2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHTOPQ9Y3Y2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHTOPQ9Y3Y2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHTOPQ9Y3Y2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHTOPQ9Y3Y2 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHTOPQ9Y3Y2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHTOPQ9Y3Y2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHTOPQ9Y3Y2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHTOPQ9Y3Y2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHTOPQ9Y3Y2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHTOPQ9Y3Y2 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHTOPQ9Y3Y2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHTOPQ9Y3Y2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHTOPQ9Y3Y2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHTOPQ9Y3Y2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHTOPQ9Y3Y2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHTOPQ9Y3Y2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHTOPQ9Y3Y2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHTOPQ9Y3Y2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHTOPQ9Y3Y2 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHTOPQ9Y3Y2 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHTOPQ9Y3Y2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHTOPQ9Y3Y2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHTOPQ9Y3Y2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHTOPQ9Y3Y2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHTOPQ9Y3Y2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHTOPQ9Y3Y2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHTOPQ9Y3Y2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHTOPQ9Y3Y2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHTOPQ9Y3Y2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHTOPQ9Y3Y2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHTOPQ9Y3Y2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHTOPQ9Y3Y2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHTOPQ9Y3Y2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHTOPQ9Y3Y2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHTOPQ9Y3Y2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHTOPQ9Y3Y2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHTOPQ9Y3Y2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHTOPQ9Y3Y2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHTOPQ9Y3Y2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHTOPQ9Y3Y2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHTOPQ9Y3Y2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHTOPQ9Y3Y2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHTOPQ9Y3Y2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CHTOPQ9Y3Y2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHTOPQ9Y3Y2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHTOPQ9Y3Y2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHTOPQ9Y3Y2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CHTOPQ9Y3Y2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CHTOPQ9Y3Y2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHTOPQ9Y3Y2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHTOPQ9Y3Y2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHTOPQ9Y3Y2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHTOPQ9Y3Y2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHTOPQ9Y3Y2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHTOPQ9Y3Y2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHTOPQ9Y3Y2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHTOPQ9Y3Y2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHTOPQ9Y3Y2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHTOPQ9Y3Y2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHTOPQ9Y3Y2 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHTOPQ9Y3Y2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHTOPQ9Y3Y2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHTOPQ9Y3Y2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHTOPQ9Y3Y2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHTOPQ9Y3Y2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHTOPQ9Y3Y2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHTOPQ9Y3Y2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHTOPQ9Y3Y2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHTOPQ9Y3Y2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHTOPQ9Y3Y2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHTOPQ9Y3Y2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHTOPQ9Y3Y2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHTOPQ9Y3Y2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHTOPQ9Y3Y2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHTOPQ9Y3Y2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHTOPQ9Y3Y2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHTOPQ9Y3Y2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHTOPQ9Y3Y2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CHTOPQ9Y3Y2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHTOPQ9Y3Y2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CHTOPQ9Y3Y2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms