Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3C4

TPRKB, EKC/KEOPS complex subunit TPRKB, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRKBQ9Y3C4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPRKBQ9Y3C4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPRKBQ9Y3C4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPRKBQ9Y3C4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPRKBQ9Y3C4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPRKBQ9Y3C4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPRKBQ9Y3C4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPRKBQ9Y3C4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPRKBQ9Y3C4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPRKBQ9Y3C4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPRKBQ9Y3C4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPRKBQ9Y3C4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TPRKBQ9Y3C4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TPRKBQ9Y3C4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TPRKBQ9Y3C4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TPRKBQ9Y3C4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TPRKBQ9Y3C4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TPRKBQ9Y3C4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TPRKBQ9Y3C4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TPRKBQ9Y3C4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TPRKBQ9Y3C4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TPRKBQ9Y3C4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPRKBQ9Y3C4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPRKBQ9Y3C4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPRKBQ9Y3C4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPRKBQ9Y3C4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPRKBQ9Y3C4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPRKBQ9Y3C4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPRKBQ9Y3C4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPRKBQ9Y3C4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPRKBQ9Y3C4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPRKBQ9Y3C4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPRKBQ9Y3C4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TPRKBQ9Y3C4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPRKBQ9Y3C4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPRKBQ9Y3C4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPRKBQ9Y3C4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPRKBQ9Y3C4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPRKBQ9Y3C4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPRKBQ9Y3C4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPRKBQ9Y3C4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPRKBQ9Y3C4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPRKBQ9Y3C4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPRKBQ9Y3C4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPRKBQ9Y3C4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPRKBQ9Y3C4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPRKBQ9Y3C4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPRKBQ9Y3C4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TPRKBQ9Y3C4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TPRKBQ9Y3C4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TPRKBQ9Y3C4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TPRKBQ9Y3C4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TPRKBQ9Y3C4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TPRKBQ9Y3C4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TPRKBQ9Y3C4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TPRKBQ9Y3C4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPRKBQ9Y3C4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPRKBQ9Y3C4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPRKBQ9Y3C4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPRKBQ9Y3C4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPRKBQ9Y3C4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPRKBQ9Y3C4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPRKBQ9Y3C4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPRKBQ9Y3C4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPRKBQ9Y3C4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPRKBQ9Y3C4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPRKBQ9Y3C4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPRKBQ9Y3C4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPRKBQ9Y3C4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPRKBQ9Y3C4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TPRKBQ9Y3C4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPRKBQ9Y3C4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPRKBQ9Y3C4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TPRKBQ9Y3C4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPRKBQ9Y3C4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPRKBQ9Y3C4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPRKBQ9Y3C4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPRKBQ9Y3C4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TPRKBQ9Y3C4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TPRKBQ9Y3C4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TPRKBQ9Y3C4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TPRKBQ9Y3C4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TPRKBQ9Y3C4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TPRKBQ9Y3C4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TPRKBQ9Y3C4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TPRKBQ9Y3C4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TPRKBQ9Y3C4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TPRKBQ9Y3C4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TPRKBQ9Y3C4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TPRKBQ9Y3C4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TPRKBQ9Y3C4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TPRKBQ9Y3C4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TPRKBQ9Y3C4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TPRKBQ9Y3C4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TPRKBQ9Y3C4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPRKBQ9Y3C4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPRKBQ9Y3C4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPRKBQ9Y3C4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPRKBQ9Y3C4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPRKBQ9Y3C4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms