Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I7

PIKFYVE, 1-phosphatidylinositol 3-phosphate 5-kinase, humanhuman

Predictions only

Length 2,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIKFYVEQ9Y2I7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PIKFYVEQ9Y2I7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PIKFYVEQ9Y2I7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PIKFYVEQ9Y2I7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PIKFYVEQ9Y2I7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PIKFYVEQ9Y2I7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PIKFYVEQ9Y2I7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PIKFYVEQ9Y2I7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PIKFYVEQ9Y2I7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PIKFYVEQ9Y2I7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PIKFYVEQ9Y2I7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PIKFYVEQ9Y2I7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PIKFYVEQ9Y2I7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PIKFYVEQ9Y2I7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PIKFYVEQ9Y2I7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PIKFYVEQ9Y2I7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PIKFYVEQ9Y2I7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PIKFYVEQ9Y2I7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PIKFYVEQ9Y2I7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PIKFYVEQ9Y2I7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PIKFYVEQ9Y2I7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PIKFYVEQ9Y2I7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PIKFYVEQ9Y2I7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PIKFYVEQ9Y2I7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PIKFYVEQ9Y2I7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PIKFYVEQ9Y2I7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PIKFYVEQ9Y2I7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PIKFYVEQ9Y2I7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PIKFYVEQ9Y2I7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PIKFYVEQ9Y2I7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PIKFYVEQ9Y2I7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PIKFYVEQ9Y2I7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PIKFYVEQ9Y2I7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PIKFYVEQ9Y2I7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PIKFYVEQ9Y2I7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PIKFYVEQ9Y2I7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PIKFYVEQ9Y2I7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PIKFYVEQ9Y2I7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PIKFYVEQ9Y2I7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PIKFYVEQ9Y2I7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PIKFYVEQ9Y2I7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PIKFYVEQ9Y2I7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PIKFYVEQ9Y2I7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PIKFYVEQ9Y2I7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PIKFYVEQ9Y2I7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PIKFYVEQ9Y2I7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PIKFYVEQ9Y2I7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PIKFYVEQ9Y2I7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PIKFYVEQ9Y2I7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PIKFYVEQ9Y2I7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PIKFYVEQ9Y2I7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PIKFYVEQ9Y2I7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PIKFYVEQ9Y2I7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PIKFYVEQ9Y2I7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PIKFYVEQ9Y2I7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PIKFYVEQ9Y2I7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PIKFYVEQ9Y2I7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PIKFYVEQ9Y2I7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PIKFYVEQ9Y2I7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PIKFYVEQ9Y2I7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PIKFYVEQ9Y2I7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PIKFYVEQ9Y2I7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PIKFYVEQ9Y2I7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PIKFYVEQ9Y2I7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PIKFYVEQ9Y2I7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIKFYVEQ9Y2I7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIKFYVEQ9Y2I7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIKFYVEQ9Y2I7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIKFYVEQ9Y2I7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIKFYVEQ9Y2I7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIKFYVEQ9Y2I7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIKFYVEQ9Y2I7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIKFYVEQ9Y2I7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIKFYVEQ9Y2I7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIKFYVEQ9Y2I7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIKFYVEQ9Y2I7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIKFYVEQ9Y2I7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIKFYVEQ9Y2I7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIKFYVEQ9Y2I7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PIKFYVEQ9Y2I7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PIKFYVEQ9Y2I7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PIKFYVEQ9Y2I7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PIKFYVEQ9Y2I7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIKFYVEQ9Y2I7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIKFYVEQ9Y2I7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIKFYVEQ9Y2I7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIKFYVEQ9Y2I7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIKFYVEQ9Y2I7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIKFYVEQ9Y2I7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIKFYVEQ9Y2I7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIKFYVEQ9Y2I7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PIKFYVEQ9Y2I7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIKFYVEQ9Y2I7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIKFYVEQ9Y2I7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PIKFYVEQ9Y2I7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PIKFYVEQ9Y2I7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PIKFYVEQ9Y2I7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PIKFYVEQ9Y2I7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PIKFYVEQ9Y2I7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PIKFYVEQ9Y2I7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms