Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I6

NINL, Ninein-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINLQ9Y2I6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
NINLQ9Y2I6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
NINLQ9Y2I6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC34.51■■■■□ 3.12
NINLQ9Y2I6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
NINLQ9Y2I6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
NINLQ9Y2I6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
NINLQ9Y2I6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
NINLQ9Y2I6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
NINLQ9Y2I6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
NINLQ9Y2I6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
NINLQ9Y2I6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
NINLQ9Y2I6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
NINLQ9Y2I6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
NINLQ9Y2I6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
NINLQ9Y2I6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
NINLQ9Y2I6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
NINLQ9Y2I6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC34.46■■■■□ 3.11
NINLQ9Y2I6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC34.46■■■■□ 3.11
NINLQ9Y2I6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
NINLQ9Y2I6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
NINLQ9Y2I6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
NINLQ9Y2I6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
NINLQ9Y2I6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
NINLQ9Y2I6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
NINLQ9Y2I6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
NINLQ9Y2I6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
NINLQ9Y2I6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
NINLQ9Y2I6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
NINLQ9Y2I6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
NINLQ9Y2I6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
NINLQ9Y2I6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
NINLQ9Y2I6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
NINLQ9Y2I6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
NINLQ9Y2I6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
NINLQ9Y2I6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
NINLQ9Y2I6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
NINLQ9Y2I6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
NINLQ9Y2I6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
NINLQ9Y2I6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC34.41■■■■□ 3.1
NINLQ9Y2I6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
NINLQ9Y2I6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC34.4■■■■□ 3.1
NINLQ9Y2I6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
NINLQ9Y2I6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
NINLQ9Y2I6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
NINLQ9Y2I6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
NINLQ9Y2I6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
NINLQ9Y2I6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
NINLQ9Y2I6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
NINLQ9Y2I6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
NINLQ9Y2I6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
NINLQ9Y2I6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
NINLQ9Y2I6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
NINLQ9Y2I6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
NINLQ9Y2I6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
NINLQ9Y2I6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
NINLQ9Y2I6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
NINLQ9Y2I6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC34.36■■■■□ 3.09
NINLQ9Y2I6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
NINLQ9Y2I6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
NINLQ9Y2I6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
NINLQ9Y2I6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
NINLQ9Y2I6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
NINLQ9Y2I6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
NINLQ9Y2I6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
NINLQ9Y2I6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
NINLQ9Y2I6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
NINLQ9Y2I6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
NINLQ9Y2I6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
NINLQ9Y2I6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
NINLQ9Y2I6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
NINLQ9Y2I6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
NINLQ9Y2I6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
NINLQ9Y2I6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
NINLQ9Y2I6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
NINLQ9Y2I6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
NINLQ9Y2I6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
NINLQ9Y2I6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
NINLQ9Y2I6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
NINLQ9Y2I6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
NINLQ9Y2I6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
NINLQ9Y2I6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
NINLQ9Y2I6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
NINLQ9Y2I6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
NINLQ9Y2I6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
NINLQ9Y2I6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
NINLQ9Y2I6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
NINLQ9Y2I6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
NINLQ9Y2I6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
NINLQ9Y2I6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
NINLQ9Y2I6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
NINLQ9Y2I6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
NINLQ9Y2I6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
NINLQ9Y2I6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
NINLQ9Y2I6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
NINLQ9Y2I6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
NINLQ9Y2I6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
NINLQ9Y2I6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
NINLQ9Y2I6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
NINLQ9Y2I6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
NINLQ9Y2I6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.7 ms