Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPM6

LHX6, LIM/homeobox protein Lhx6, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX6Q9UPM6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LHX6Q9UPM6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LHX6Q9UPM6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LHX6Q9UPM6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LHX6Q9UPM6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LHX6Q9UPM6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LHX6Q9UPM6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LHX6Q9UPM6 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LHX6Q9UPM6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LHX6Q9UPM6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LHX6Q9UPM6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LHX6Q9UPM6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LHX6Q9UPM6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LHX6Q9UPM6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LHX6Q9UPM6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LHX6Q9UPM6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
LHX6Q9UPM6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LHX6Q9UPM6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LHX6Q9UPM6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LHX6Q9UPM6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LHX6Q9UPM6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LHX6Q9UPM6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LHX6Q9UPM6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LHX6Q9UPM6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LHX6Q9UPM6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LHX6Q9UPM6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LHX6Q9UPM6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LHX6Q9UPM6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LHX6Q9UPM6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LHX6Q9UPM6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LHX6Q9UPM6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LHX6Q9UPM6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LHX6Q9UPM6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LHX6Q9UPM6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LHX6Q9UPM6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LHX6Q9UPM6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LHX6Q9UPM6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LHX6Q9UPM6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LHX6Q9UPM6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LHX6Q9UPM6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LHX6Q9UPM6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LHX6Q9UPM6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LHX6Q9UPM6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LHX6Q9UPM6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LHX6Q9UPM6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LHX6Q9UPM6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LHX6Q9UPM6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LHX6Q9UPM6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LHX6Q9UPM6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LHX6Q9UPM6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LHX6Q9UPM6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LHX6Q9UPM6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LHX6Q9UPM6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LHX6Q9UPM6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
LHX6Q9UPM6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LHX6Q9UPM6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
LHX6Q9UPM6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LHX6Q9UPM6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LHX6Q9UPM6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LHX6Q9UPM6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LHX6Q9UPM6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LHX6Q9UPM6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LHX6Q9UPM6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LHX6Q9UPM6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LHX6Q9UPM6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LHX6Q9UPM6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LHX6Q9UPM6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LHX6Q9UPM6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LHX6Q9UPM6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LHX6Q9UPM6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LHX6Q9UPM6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LHX6Q9UPM6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LHX6Q9UPM6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LHX6Q9UPM6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LHX6Q9UPM6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LHX6Q9UPM6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LHX6Q9UPM6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LHX6Q9UPM6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LHX6Q9UPM6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LHX6Q9UPM6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LHX6Q9UPM6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LHX6Q9UPM6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LHX6Q9UPM6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LHX6Q9UPM6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LHX6Q9UPM6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LHX6Q9UPM6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LHX6Q9UPM6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LHX6Q9UPM6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LHX6Q9UPM6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LHX6Q9UPM6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LHX6Q9UPM6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LHX6Q9UPM6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LHX6Q9UPM6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LHX6Q9UPM6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LHX6Q9UPM6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LHX6Q9UPM6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LHX6Q9UPM6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LHX6Q9UPM6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LHX6Q9UPM6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LHX6Q9UPM6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms