Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV3

CIZ1, Cip1-interacting zinc finger protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIZ1Q9ULV3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CIZ1Q9ULV3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CIZ1Q9ULV3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CIZ1Q9ULV3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CIZ1Q9ULV3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CIZ1Q9ULV3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CIZ1Q9ULV3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CIZ1Q9ULV3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CIZ1Q9ULV3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CIZ1Q9ULV3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CIZ1Q9ULV3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
CIZ1Q9ULV3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CIZ1Q9ULV3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CIZ1Q9ULV3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
CIZ1Q9ULV3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CIZ1Q9ULV3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CIZ1Q9ULV3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CIZ1Q9ULV3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CIZ1Q9ULV3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CIZ1Q9ULV3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
CIZ1Q9ULV3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CIZ1Q9ULV3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CIZ1Q9ULV3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CIZ1Q9ULV3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CIZ1Q9ULV3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CIZ1Q9ULV3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CIZ1Q9ULV3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CIZ1Q9ULV3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CIZ1Q9ULV3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CIZ1Q9ULV3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CIZ1Q9ULV3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CIZ1Q9ULV3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
CIZ1Q9ULV3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CIZ1Q9ULV3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CIZ1Q9ULV3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
CIZ1Q9ULV3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CIZ1Q9ULV3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CIZ1Q9ULV3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CIZ1Q9ULV3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CIZ1Q9ULV3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CIZ1Q9ULV3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CIZ1Q9ULV3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
CIZ1Q9ULV3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CIZ1Q9ULV3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CIZ1Q9ULV3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CIZ1Q9ULV3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CIZ1Q9ULV3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CIZ1Q9ULV3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CIZ1Q9ULV3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CIZ1Q9ULV3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CIZ1Q9ULV3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CIZ1Q9ULV3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CIZ1Q9ULV3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CIZ1Q9ULV3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CIZ1Q9ULV3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CIZ1Q9ULV3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CIZ1Q9ULV3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CIZ1Q9ULV3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CIZ1Q9ULV3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CIZ1Q9ULV3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CIZ1Q9ULV3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CIZ1Q9ULV3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CIZ1Q9ULV3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CIZ1Q9ULV3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CIZ1Q9ULV3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CIZ1Q9ULV3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CIZ1Q9ULV3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CIZ1Q9ULV3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
CIZ1Q9ULV3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CIZ1Q9ULV3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CIZ1Q9ULV3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CIZ1Q9ULV3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CIZ1Q9ULV3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CIZ1Q9ULV3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CIZ1Q9ULV3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CIZ1Q9ULV3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CIZ1Q9ULV3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CIZ1Q9ULV3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CIZ1Q9ULV3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CIZ1Q9ULV3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CIZ1Q9ULV3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
CIZ1Q9ULV3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CIZ1Q9ULV3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CIZ1Q9ULV3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CIZ1Q9ULV3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CIZ1Q9ULV3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CIZ1Q9ULV3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CIZ1Q9ULV3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CIZ1Q9ULV3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
CIZ1Q9ULV3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CIZ1Q9ULV3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CIZ1Q9ULV3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CIZ1Q9ULV3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CIZ1Q9ULV3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CIZ1Q9ULV3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CIZ1Q9ULV3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CIZ1Q9ULV3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CIZ1Q9ULV3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CIZ1Q9ULV3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CIZ1Q9ULV3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms